梯度PCR基因扩增仪是由普通PCR仪衍生出的带梯度PCR功能的基因扩增仪。PCR反应能否成功，退火温度是关键，梯度PCR基因扩增仪每个孔的温度可以在范围内按照梯度设置，根据结果，一步就可以摸索出适反应条件。一次性PCR扩增可以设置一系列不同的退火温度条件（通常12种温度梯度）的称之为梯度PCR基因扩增仪。因为被扩增的不同的DNA片段其适合的退火温度不同，通过设置一系列的梯度退火温度进行扩增，从而一次性PCR扩增就可以筛选出表达量高的适合退火温度进行有效的扩增。主要用于研究未知DNA退火温度的扩增，这样可节省试验时间、提高实验效率，又节约实验成本。在不设置梯度的情况下亦可当做普通的PCR用。梯度PCR基因扩增仪多应用于科研、教学机构。
梯度PCR基因扩增仪适用于分子生物学、医学、食品工业、司法科学、生物技术、环境科学、微生物学、临床诊断、流行病学、遗传学、基因芯片、基因检测、基因克隆、基因表达等领域以聚合酶链式反应（Picymerase Chain Reaction , PCR）为特征的、以检测DNA/RNA为目的的各种病原体检测及基因分析。
梯度PCR基因扩增仪除具有上述标准PCR功能以外，其梯度模块还能同时进行多达12个不同退火温度的PCR反应，在梯度模块上，可实现对梯度温度和梯度宽度等参数的调整，自由编程12道温度，有梯度实现不同样品的退火温度并同时进行热循环，仅次实验就能确定特征体系相应的退火温度，从而可在短时间内对PCR实验进行化，大大提ＰＣＲ科研效率
